“神舟”號飛船于１９９９年１１月２０日６時３０分在酒泉衛星發射中心搭載長徵運載火箭發射升空，次日３時４１分在內蒙古自治區中部地區成功著陸。

　　這次發射首次採用了在技術廠房對飛船、火箭聯合體垂直總裝與測試，整體垂直運輸至發射場，進行遠距離測試發射控制的新模式。在原有航天測控網基礎上新建的符合國際標準體制的陸海基航天測控網，也在這次發射試驗中首次投入使用。

　　“神舟”號試驗飛船的成功發射與回收是中國航天史上的里程碑，標志著載人航天技術獲得了新的重大突破。

　　“神舟”二號飛船于２００１年１月１０日在酒泉衛星發射中心發射升空，在軌飛行７天後成功返回地面。“神舟”二號是中國第一艘正樣無人飛船，由軌道艙、返回艙和推進艙組成。與“神舟”號相比，“神舟”二號的係統結構有了新的擴展，技術性能有了新的提高，飛船技術狀態與載人飛船基本一致。

　　科學家在“神舟”二號上進行了微重力環境下空間生命科學、空間材料、空間天文和物理等領域的實驗，具體包括：半導體光電子材料、氧化物晶體、金屬合金等多種材料的晶體生長；蛋白質和其他生物大分子的空間晶體生長；植物、動物、水生生物、微生物及離體細胞和細胞組織的空間環境效應實驗等。

　　飛船在軌運行期間，各種試驗儀器設備性能穩定，工作正常，取得了大量寶貴的飛行試驗數據。